A Vidékfejlesztési Minisztérium intézkedéseinek köszönhetően lezárultak azok a kötelezettségszegési eljárások, amiket még 2008 és 2010 között indított hazánk ellen az Európai Bizottság a Natura 2000 erdőkben történt, jellemzően illegális fakitermelések miatt. A Bizottság elsősorban azt kifogásolta, hogy a magyar hatósági felügyeleti rendszer nem ad megfelelő védelmet a közösségi jelentőségű erdei élőhelyeknek.

Első lépésként az erdészeti hatóságok egy rendkívül szigorú Natura 2000 hatásvizsgálati rendszert vezettek be, amelyet az Európai Bizottság is elfogadott és eredményesnek ítélt. A Vidékfejlesztési Minisztérium ezután a hatásvizsgálatokból fakadó korlátozások ellentételezésére 2012-ben a vidékfejlesztési forrásokból elindította a Natura 2000 erdő kompenzációs támogatást. Ez az egyik legsikeresebb erdészeti vidékfejlesztési intézkedés lett. A minisztérium és az erdőgazdálkodók együttműködése azzal vált teljessé, hogy az uniós elvárások teljesülését megfelelő EU-s források hozzárendelésével biztosították.